مدیریت امور پژوهشی دانشگاه اراک مسئولیت ایجاد بستر مناسب و تسهیل انجام فعالیتهای پژوهشی اعضای هیئتعلمی این دانشگاه را بر عهده دارد و در همین راستا، ضمن تعیین اولویتهای پژوهشی و تصویب آن در شورای پژوهشی دانشگاه، زمینه لازم برای فعالیت اعضای هیئتعلمی را نیز فراهم مینماید. این واحد در تلاش است تا طرحهای پژوهشی اعضای هیئتعلمی، ضمن حفظ کیفیت بالای پژوهشی، در حداقل زمان ممکن بررسی، داوری و آماده اجرا گردند. این بخش همچنین مسئولیت انتشار کتابهای علمی اعم از تألیف، تصنیف و ترجمه، که توسط اعضای هیئتعلمی این دانشگاه انجام میشوند را بر عهده دارد. ایجاد زمینه جهت چاپ مقالات و تسهیل شرکت اعضای هیئتعلمی در کنفرانسهای داخل و خارج از کشور و همچنین اعزام به فرصت مطالعاتی، از دیگر وظایف و مسئولیتهای این بخش میباشد.
در سالهای اخیر با حمایت مالی و پشتیبانی معاونت پژوهشی همایشهای علمی متعددی در دانشگاه برگزار شده است که از آنجمله میتوان به هجدهمین کنفرانس ملی جوش و هفتمین کنفرانس ملی آزمونهای غیر مخرب در دانشگاه اراک، بیستمین کنفرانس ملی شیمی فیزیک ایران، بیست و سومین سمینار آنالیز ریاضی و کاربردهای آن، پژوهشهای ماموریت گرا، کلید تعامل صنعت و دانشگاه، همایش استانی روشهای نگهداشت آب و خاک و محیط زیست، همایش ملی کاربردهای فناوری نانو در کشاورزی و همچنین اولین همایش ملی کیفیت منابع آب و توسعه پایدار اشاره کرد.